25.04.2013

С помощью Java будут программировать ДНК

Ученые-биотехнологи BIOFAB пытаются создать механизм управления генетической информацией, который позволит программировать живые клетки.

Спрашивается, если компьютерные системы уже с конца шестидесятых годов XX века во многом создавались по образу и подобию живых организмов, то почему не может быть наоборот? Так считает и Дрю Энди, один из руководителей международной научной организации Open Facility Advancing Biotechnology (BIOFAB). Он сообщил авторитетному западному ресурсу Wired, что в настоящий момент ведется разработка своего рода «языка программирования», использующего генетические данные для изменения поведения живых клеток.

Идея команды BIOFAB состоит в том, чтобы внутри живой клетки построить платформу для программирования наподобие виртуальной машины Java, которая будет работать на самых различных типах клеток и управлять генетической информацией. Работая над базовыми конструкционными блоками, своеобразной «грамматикой» языка, специалисты генной инженерии уже добились первых успехов. Если еще год назад на то, чтобы вызвать экспрессию всего одного гена, требовалось около семисот попыток, то сегодня возможно искусственно вызвать экспрессию до десяти генов.

По словам Цива Бар-Йозефа, специалиста по биоинформатике университета Карнеги-Меллон, механизм генной экспрессии не сильно отличается от того, как сообщаются между собой компьютерные системы, причем одно и то же поведение наблюдается от системы к системе. Поэтому в ближайшее время команда намерена искать коммерческую компанию, которая сможет помочь BIOFAB воссоздать это видение Java – очень близкое к оригинальному видению Sun Microsystems (создателя Java) – в мире биологии. Как и Sun, команда Энди придерживается философии Open Source: язык BIOFAB будет бесплатно доступен для использования, а его разработка будет вестись сообществом.

Проект BIOFAB пока что находится на ранней стадии, однако Энди убежден, что работа его команды не только имеет огромную важность, но и гораздо более применима в реальной жизни, нежели люди могут себе вообразить.

Текст: lacerta.su, по материалам ресурса Wired
Фото: medicalintelligence.co.uk